Koku sakņu sistēmai ir divas ļoti svarīgas funkcijas: mehāniskā un fizioloģiskā.Pirmais ir noenkurot augu zemē, kas ļauj saglabāt taisnu stāju, otrs ir nodrošināt lapas un dzinumus ar ūdeni un minerālvielām.Turklāt saknes uzglabā rezerves vielas (galvenokārt cieti) un nodrošina koka simbiozi ar noteiktām sēņu vai baktēriju sugām (piemēram, alksnis un pupas veido sabiezējumus uz saknēm, kuros mīt slāpekļa baktērijas)
Tam pievienota veģetatīvās pavairošanas iespēja ar sakņu piesūcekņiem. Daudzi koki, kas aug grupās, nerodas no sēklām, bet veģetatīvi no sakņu piesūcējiem, piem.vītoli, papeles, etiķkoki, spārnrieksti, spārnkoki, melnlapu olīvas, robins.Šī veģetatīvās pavairošanas metode noved pie kļavas veidošanās, t.i., augi ar tādām pašām īpašībām kā mātesaugam.
Koki veido divus sakņu sistēmas pamatveidus: kaudzi, kurai ir viena pamatsakne, kas aug vertikāli uz leju, no kuras izaug tievākas sānsaknes, un saišķis, kuram no auga pamatnes izaug daudzas vienādas, salīdzinoši plānas saknes. .Atkarībā no galvenās saknes augšanas stipruma un sānu sakņu atrašanās vietas pāļu sistēmu iedala trīs veidos: tipiskā kaudzīte, sirds formas (saukta par slīpi) un horizontāla (vai plakana).
Koki ar tipisku sirds formas kaudzes sakņu sistēmu mēdz būt stabilāki, jo ir lielāks sakņu dziļums un bieza, spēcīga pamatsakne vai vairākas biezas, slīpas saknes.Tomēr lielākā daļa koku ir sugas ar plašu, bet seklu sakņu sistēmu, piemēram, egle, palmu kļava, parastais ceriņš, kārpainais bērzs un sūnains bērzs
Tie rada lielu skaitu mazu sakņu, kas sacenšas par ūdeni un barības vielāmSudrabai kļavai, smaganām, papeles, vītoliem, kaukāziešu spārnriekstiem, ķīniešu metasekvojām ir ļoti "agresīvas" saknes ietvju flīžu vai pat asf alta uzspridzināšana. Seklo, bet jutīgo sistēmu veido pagodas un vērpes kizils un japāņu priede. Ābelēm, ķiršiem, skābajiem ķiršiem, Amūras korķim un Londonas platānai ir bagātīgi zarota sakņu sistēma.
Interesanti, ka praktiski nav nokritušu priežu vai ozolu, t.i., koku ar dziļu, tipiski sakņu sistēmu (pateicoties pāļu sakņu sistēmai, priedes ir slavenas ar izcilu stabilitāti pat smilšainās vietās )Dziļa un labi attīstīta sistēma sastāv no platānas kļavas, melnajiem siseņiem, rūgtajiem hikorijas, pieclapu un septiņu lapu ķipariem, ēdamajiem kastaņiem, dzeltenajām pākstīm, vienkakla un divkakla vilkābele, pīlādži un īve. Parastais osis ir viena no dziļākajām sakņu sistēmām, trīs ērkšķi, Kanādas krustnagliņas, kalnu sniegs, b altais zīdkoks un goba ir dziļi iesakņojušies.
Nabadzīgās, sausās un labi drenētās augsnēs kokiem parasti veidojas dziļākas un platākas saknes nekā auglīgās un mitrās augsnēs.Priedes, ozols un citas dziļi iesakņojušās sugas - ja tās audzē seklās vai mitrās augsnēs - veido horizontālu sistēmu, kā parasti egle.Alksnis, kas aug svaigās augsnēs, ir ar slīpu sistēmu, savukārt mitrās augsnēs - horizontāli. Jaunu bērzu saknes iegrimst elkonī, ne pārāk dziļi zem virsmas, savukārt vecākiem bērziem ir raksturīga sirdsveida sakņu sistēma.
Kokiem ar platu vainagu, augot atklātā vietā, ir daudz lielāka sakņu masa nekā kokiem, kas aug kompakti, un rezultātā tiem ir mazāk attīstīts vainags. Šī parādība vērojama mežā augošajos kokos, piemēram, priedē, eglē, ozolā vai dižskābaržāJāuzsver, ka spēcīgāks vainaga bojājums ietekmē sakņu sistēmas augšanu, bet spēcīgāks sakņu bojājums kavē sakņu sistēmas augšanu. koka virszemes daļas augšana.